Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trim24Q64127 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trim24Q64127 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Trim24Q64127 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim24Q64127 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Trim24Q64127 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Trim24Q64127 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Trim24Q64127 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Trim24Q64127 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Trim24Q64127 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim24Q64127 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms