Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa17Q64016 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms