Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col4a5Q63ZW6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms