Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup62Q63850 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms