Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zic2Q62520 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zic2Q62520 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms