Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn4Q62472 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn4Q62472 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms