Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga3Q62470 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms