Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp4Q62445 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms