Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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Hoxa13Q62424 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Hoxa13Q62424 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Hoxa13Q62424 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Hoxa13Q62424 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Hoxa13Q62424 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Hoxa13Q62424 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Hoxa13Q62424 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms