Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Epha6Q62413 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha6Q62413 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha6Q62413 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms