Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhQ62361 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhQ62361 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhQ62361 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrhQ62361 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrhQ62361 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms