Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a2Q62203 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms