Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhocQ62159 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhocQ62159 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms