Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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Prm3Q62100 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prm3Q62100 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prm3Q62100 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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