Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phox2aQ62066 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phox2aQ62066 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms