Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctr9Q62018 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctr9Q62018 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctr9Q62018 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms