Protein–RNA interactions for Protein: Q61751

Znf354a, Zinc finger protein 354A, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354aQ61751 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354aQ61751 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354aQ61751 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms