Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msi1Q61474 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Msi1Q61474 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms