Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cacna1eQ61290 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1eQ61290 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms