Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
AcanQ61282 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AcanQ61282 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms