Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acvr1bQ61271 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acvr1bQ61271 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acvr1bQ61271 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acvr1bQ61271 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acvr1bQ61271 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acvr1bQ61271 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acvr1bQ61271 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Acvr1bQ61271 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acvr1bQ61271 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acvr1bQ61271 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms