Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc1Q61056 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc1Q61056 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms