Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxg1Q60987 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms