Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp7Q60973 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp7Q60973 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp7Q60973 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms