Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp1r1bQ60829 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp1r1bQ60829 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppp1r1bQ60829 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms