Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nr2f1Q60632 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nr2f1Q60632 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms