Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sema5bQ60519 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema5bQ60519 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms