Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp13a3Q5XF89 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atp13a3Q5XF89 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms