Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Specc1Q5SXY1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Specc1Q5SXY1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms