Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynrgQ5SV85 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynrgQ5SV85 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SynrgQ5SV85 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SynrgQ5SV85 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SynrgQ5SV85 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SynrgQ5SV85 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms