Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sco1Q5SUC9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sco1Q5SUC9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms