Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam71bQ5STT6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam71bQ5STT6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms