Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zzef1Q5SSH7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zzef1Q5SSH7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms