Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps54Q5SPW0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps54Q5SPW0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms