Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trdv2-2Q5R1A4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trdv2-2Q5R1A4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms