Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim58Q5NCC9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim58Q5NCC9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms