Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5431Q5NCB3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5431Q5NCB3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5431Q5NCB3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms