Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clhc1Q5M6W3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clhc1Q5M6W3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms