Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf5Q5EBH1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rassf5Q5EBH1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms