Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354cQ571J5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354cQ571J5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms