Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccnl1Q52KE7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccnl1Q52KE7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms