Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms