Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ulk4Q3V129 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ulk4Q3V129 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ulk4Q3V129 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms