Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc110Q3V125 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc110Q3V125 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms