Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700057G04RikQ3V0U0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms