Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc27Q3V036 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc27Q3V036 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms