Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms