Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm6899Q3USS0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6899Q3USS0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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