Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1lQ3USQ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1lQ3USQ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms