Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhdc9Q3USL1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Klhdc9Q3USL1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms